- calculateMessageDigest() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- cancelJob() - インタフェース のメソッドome.api.JobHandle
-
Marks a job for cancellation.
- CANCELLED - インタフェース のstatic変数ome.api.JobHandle
-
- canRead(EventContext, String) - クラス のメソッドome.system.PreferenceContext
-
- canUpdate(IObject) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Returns true if the currently logged in user can modify the given
IObject
.
- ceId - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- ceType - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- cgId - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- cgName - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- changeExpiredCredentials(String, String, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Used after an ExpiredCredentialException
instance is thrown.
- changeGroup(IObject, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
call
details.setGroup()
on this instance.
- changeOwner(IObject, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
call
details.setOwner()
on this instance.
- changePassword(String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
change the password for the current user.
- changePasswordWithOldPassword(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
change the password for the current user by passing the old password.
- changePermissions(IObject, Permissions) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
call
defaults.setPermissions()
on this instance.
- changeUserPassword(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
change the password for the a given user.
- checkDatabase(String) - クラス のメソッドome.system.PreferenceContext
-
- checkImageDelete(long, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IDelete
-
Returns all entities which would prevent the given Image
id from
being deleted.
- checksumAsBytes() - クラス のメソッドome.util.checksum.AbstractChecksumProvider
-
- checksumAsBytes() - インタフェース のメソッドome.util.checksum.ChecksumProvider
-
Returns a byte array representation of the calculated checksum.
- checksumAsBytes() - クラス のメソッドome.util.checksum.FileSizeChecksumProviderImpl
-
- checksumAsString() - クラス のメソッドome.util.checksum.AbstractChecksumProvider
-
- checksumAsString() - インタフェース のメソッドome.util.checksum.ChecksumProvider
-
Returns a String
representing the checksum in hex form.
- checksumAsString() - クラス のメソッドome.util.checksum.FileSizeChecksumProviderImpl
-
- ChecksumProvider - ome.util.checksumのインタフェース
-
An interface producing checksums or message digests (depending on the
implementing class) of a given type of input.
- ChecksumProviderFactory - ome.util.checksumのインタフェース
-
- ChecksumProviderFactoryImpl - ome.util.checksumのクラス
-
- ChecksumProviderFactoryImpl() - クラス のコンストラクタome.util.checksum.ChecksumProviderFactoryImpl
-
- ChecksumType - ome.util.checksumの列挙型
-
Enumeration defining the possible algorithms used for calculating checksums.
- clearQueries() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
- CLIENT_CONTEXT - クラス のstatic変数ome.system.OmeroContext
-
identifier for an OmeroContext configured in
classpath*:beanRefContext.xml for use by remote (via JNDI/RMI) clients.
- close() - インタフェース のメソッドome.api.StatefulServiceInterface
-
signals the end of the service lifecycle.
- closeAll() - クラス のメソッドome.system.OmeroContext
-
closes all the nested OmeroContexts within this instance.
- closeSession(Session) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Closes session and releases all resources.
- closeSession() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- closeShare(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Closes share
.
- CodomainMap - omeis.providers.re.codomainのインタフェース
-
Declares the interface common to all codomain maps.
- CodomainMapContext - omeis.providers.re.codomainのクラス
-
Each concrete subclass defines transformation parameters for a
CodomainMap
implementation.
- CodomainMapContext() - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.codomain.CodomainMapContext
-
- containedExperimenters(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
fetch all users
contained in this group.
- containedGroups(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
fetch all groups
of which the given user is a
member.
- Context(Timer.Context) - クラス のコンストラクタome.system.metrics.DefaultTimer.Context
-
- ContrastStretchingContext - omeis.providers.re.codomainのクラス
-
Two points pStart
and pEnd
define the context
of this transformation.
- ContrastStretchingContext() - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
- copy(EventContext) - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
Copies all values directly from the given instance into this instance.
- copy() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.CodomainMapContext
-
Returns a deep copy of this object.
- copy() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Implemented as specified by superclass.
- copy() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.IdentityMapContext
-
Implemented as specified by superclass.
- copy() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Implemented as specified by superclass.
- copy() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ReverseIntensityContext
-
非推奨です。
Implemented as specified by superclass.
- copyAndResizeImage(long, Integer, Integer, Integer, Integer, List<Integer>, String, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Copies the metadata, and only the metadata linked to a Image
object into a new Image object of equal or differing size across one
or many of its three physical dimensions or temporal dimension.
- copyAndResizePixels(long, Integer, Integer, Integer, Integer, List<Integer>, String, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Copies the metadata, and only the metadata linked to a Pixels
object into a new Pixels object of equal or differing size across one
or many of its three physical dimensions or temporal dimension.
- countAnnotationsUsedNotOwned(Class, long) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Counts the number of annotation of a given type used by the specified
user but not owned by the user.
- Counter - ome.system.metricsのインタフェース
-
Thin wrapper around Counter
- counter(Object, String) - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultMetrics
-
- counter(Object, String) - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Metrics
-
- counter(Object, String) - クラス のメソッドome.system.metrics.NullMetrics
-
- countSpecifiedAnnotations(Class, Set<String>, Set<String>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Counts the number of annotation of a given type.
- CRC32ChecksumProviderImpl - ome.util.checksumのクラス
-
An implementation of the
ChecksumProvider
interface using
CRC32 as the message digest algorithm.
- CRC32ChecksumProviderImpl() - クラス のコンストラクタome.util.checksum.CRC32ChecksumProviderImpl
-
- createDataObject(T, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Creates the specified data object.
- createDataObjects(IObject[], Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
convenience method to save network calls.
- createEnumeration(T) - インタフェース のメソッドome.api.ITypes
-
- createExperimenter(Experimenter, ExperimenterGroup, ExperimenterGroup...) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
create and return a new user in the given groups.
- createExperimenterWithPassword(Experimenter, String, ExperimenterGroup, ExperimenterGroup...) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
create and return a new user in the given groups with password.
- createGroup(ExperimenterGroup) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
create and return a new group.
- createImage(int, int, int, int, List<Integer>, PixelsType, String, String) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Creates the metadata, and only the metadata linked to an Image
object.
- createJobHandle() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- createNewRenderingDef(Pixels) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Creates a new rendering definition object along with its sub-objects.
- createPrincipal() - クラス のメソッドome.system.SessionInitializer
-
- createRawFileStore() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- createRawPixelsStore() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- createRenderingEngine() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- createRestrictedSystemUser(Experimenter, List<AdminPrivilege>) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Create and return a new system user.
- createRestrictedSystemUserWithPassword(Experimenter, List<AdminPrivilege>, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Create and return a new system user.
- createSearchService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- createSession(Principal, String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Creates a new session and returns it to the user.
- createSessionWithTimeout(Principal, long) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Allows an admin to create a
Session
for the give
Principal
- createSessionWithTimeouts(Principal, long, long) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Allows an admin to create a
Session
for the give
Principal
- createShare(String, Timestamp, List<T>, List<Experimenter>, List<String>, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Creates share
with all related:
items
, members
, and guests.
- createSystemUser(Experimenter) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
create and return a new system user.
- createThumbnail(Integer, Integer) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Creates a thumbnail for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef) in the on-disk cache.
- createThumbnails() - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Creates thumbnails for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef) in the on-disk cache for every
sizeX/sizeY combination already cached.
- createThumbnailsByLongestSideSet(Integer, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Creates thumbnails for a number of pixels sets using a given set of
rendering settings (RenderingDef) in the on-disk cache.
- createThumbnailService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- createUser(Experimenter, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
create and return a new user.
- createUser(String) - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
Creates an Experimenter
entry in the OMERO DB
based on the supplied LDAP username.
- createUserSession(long, long, String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Allows a user to open up another session for him/herself with the given
defaults without needing to re-enter password.
- credentials - クラス の変数ome.system.SessionInitializer
-
- csId - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- csName - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- csuId - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- csuName - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- ctx - クラス の変数ome.system.ServiceFactory
-
- cuId - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- cuName - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- currentMetadata() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Provides access to the extra query information (for example Lucene score
and boost values) for a single call to
Search.next()
.
- currentMetadataList() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Provides access to the extra query information (for example Lucene score
and boost values) for a single call to
Search.results()
.
- G_BAND - クラス のstatic変数omeis.providers.re.RGBBuffer
-
Index of the green band in the image's data buffer.
- get(Class<T>, long) - インタフェース のメソッドome.api.IQuery
-
lookup an entity by class and id.
- get75thPercentile() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- get75thPercentile() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- get95thPercentile() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- get95thPercentile() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- get98thPercentile() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- get98thPercentile() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- get999thPercentile() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- get999thPercentile() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- get99thPercentile() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- get99thPercentile() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getA0() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the slope of the first line.
- getA1() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the slope of the second line.
- getA2() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the slope of the third line.
- getActiveConnections(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets actual active connections to share
.
- getAdminPrivileges(Experimenter) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Gets the light administrator privileges for the given user.
- getAdminService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getAdminsWithPrivileges(List<AdminPrivilege>) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Gets the administrators who have all the given privileges.
- getAllDatasets() - インタフェース のメソッドome.api.IAnalysis
-
- getAllEnumerations(Class<T>) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Retrieves the exhaustive list of enumerations for a given enumeration
class.
- getAllForImage(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAnalysis
-
- getAllGuests(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Get the email addresses for all share guests.
- getAllMembers(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Get all users
who are a member of the share.
- getAllUsers(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Get a single set containing the
login names
of the users as well email addresses for guests.
- getAnalysisService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getAnnotationTypes() - インタフェース のメソッドome.api.ITypes
-
Returns a list of classes which implement IAnnotated
.
- getAvailableFamilies() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the list of mapping families supported by the Rendering engine.
- getAvailableModels() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the list of color models supported by the Rendering engine.
- getAvailableTypes() - インタフェース のメソッドome.util.checksum.ChecksumProviderFactory
-
- getAvailableTypes() - クラス のメソッドome.util.checksum.ChecksumProviderFactoryImpl
-
- getB0() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the y-intercept of the first line.
- getB1() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the y-intercept of the second line.
- getB2() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the y-intercept of the third line.
- getBatchSize() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Returns the current batch size.
- getBitDepth(PixelsType) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Bit depth for a given pixel type.
- getBlue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.lut.LutReader
-
Returns the blue value.
- getBlueBand() - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Returns the data buffer for the blue band.
- getBlueValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Retrieves the Blue value for a particular pixel index.
- getBlueValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Retrieves the Blue value for a particular pixel index.
- getBlueValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Retrieves the Blue value for a particular pixel index.
- getByteWidth() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getChannelCurveCoefficient(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the coefficient identifying a map in the family.
- getChannelFamily(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the family associated to the specified channel.
- getChannelLookupTable(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- getChannelNoiseReduction(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns true
if the noise reduction algorithm used to map
the pixels intensity values is turned on, false
if the
algorithm is turned off.
- getChannelStats(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- getChannelWindowEnd(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the upper bound of the pixels intensity interval.
- getChannelWindowStart(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the lower bound of the pixels intensity interval.
- getClientConfigDefaults() - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
reads the etc/omero.properties file and returns all the key/value
pairs that are found there which match the prefix "omero.client".
- getClientConfigValues() - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
- getClientContext() - クラス のstaticメソッドome.system.OmeroContext
-
create (if necessary) and return the single default client OmeroContext.
- getClientContext(Properties) - クラス のstaticメソッドome.system.OmeroContext
-
- getCodomainMapContext(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the list of codomain contexts associated to the specified
channel.
- getCol(int, int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getCollectionCount(String, String, Set<Long>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Counts the number of members in a collection for a given object.
- getCommentCount(Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Returns a map from share id to comment count.
- getComments(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Looks up all comments
which
belong to the share
.
- getCompressionLevel() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the current compression level for the service.
- getConfigDefaults() - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
reads the etc/omero.properties file and returns all the key/value
pairs that are found there.
- getConfigService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getConfigValue(String) - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
retrieve a configuration value from the backend store.
- getConfigValues(String) - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
retrieves configuration values from the backend store which match the
given regex.
- getContainerService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getContentMap(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Returns the contents of the share keyed by type.
- getContents(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Looks up all items
belong to the
share
.
- getContentSize(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Returns the number of items in the share.
- getContentSubList(long, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Returns a range of items from the share.
- getContext(Properties, String) - クラス のstaticメソッドome.system.OmeroContext
-
initialize a new client OmeroContext using the Properties
provided as values for property (e.g.
- getCount() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Counter
-
- getCount() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultCounter
-
- getCount() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultTimer
-
- getCount() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Timer
-
- getCurrentAdminPrivileges() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Gets the light administrator privileges for the current user.
- getCurrentAdminPrivileges() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentAdminPrivileges() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentEventContext() - インタフェース のメソッドome.api.StatefulServiceInterface
-
- getCurrentEventId() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentEventId() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentEventType() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentEventType() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentGroupId() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentGroupId() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentGroupName() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentGroupName() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentGroupPermissions() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentGroupPermissions() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentSessionId() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentSessionId() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentSessionUuid() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentSessionUuid() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentShareId() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentShareId() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentSudoerId() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentSudoerId() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentSudoerName() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentSudoerName() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentUmask() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentUserId() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentUserId() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getCurrentUserName() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getCurrentUserName() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getDatabaseTime() - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
checks the database for its time using a SELECT statement.
- getDatabaseUuid() - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
Provides the UUID for this OMERO (database) instance.
- getDataBuffer() - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Retrieves the data buffer that contains the pixel values.
- getDataBuffer() - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Retrieves the data buffer that contains the pixel values.
- getDatasetsForProject(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAnalysis
-
- getDefaultContext() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
used when no
context
name is provided to the
constructor.
- getDefaultGroup(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
retrieve the default group
for the given user
id.
- getDefaultT() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the default timepoint index.
- getDefaultZ() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the index of the default focal section.
- getDeleteService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getEnumeration(Class<T>, String) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Retrieves a particular enumeration for a given enumeration class.
- getEnumeration(Class<T>, String) - インタフェース のメソッドome.api.ITypes
-
lookup an enumeration value.
- getEnumerationsWithEntries() - インタフェース のメソッドome.api.ITypes
-
Gets all metadata classes which are IEnum type with contained objects.
- getEnumerationTypes() - インタフェース のメソッドome.api.ITypes
-
Gets all metadata classes which are IEnum type.
- getEvent() - クラス のメソッドome.system.Login
-
simple getter for the event type passed into the constructor
- getEventContext() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
returns an implementation of
EventContext
loaded with the
security for the current user and thread.
- getEvents(long, Experimenter, Timestamp, Timestamp) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets events for share
per
experimenter
for period of time.
- getEventType() - クラス のメソッドome.system.Principal
-
- getException() - 例外 のメソッドome.util.messages.MessageException
-
Get the exception which this instance wraps.
- getExceptionThrown() - クラス のメソッドome.system.UpgradeCheck
-
- getExperimenter(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
fetch an Experimenter
and all related
groups
.
- getFileId() - インタフェース のメソッドome.api.RawFileStore
-
Returns the current file id or null if none has been set.
- getFreeSpaceInKilobytes() - インタフェース のメソッドome.api.IRepositoryInfo
-
This method returns the free or available space on this file system
including nested subdirectories.
- getGreen(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.lut.LutReader
-
Returns the green value.
- getGreenBand() - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Returns the data buffer for the green band.
- getGreenValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Retrieves the Green value for a particular pixel index.
- getGreenValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Retrieves the Green value for a particular pixel index.
- getGreenValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Retrieves the Green value for a particular pixel index.
- getGroup(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
fetch an ExperimenterGroup
and all contained
users
.
- getGroup() - クラス のメソッドome.system.Login
-
simple getter for the group name passed into the constructor
- getGroup() - クラス のメソッドome.system.Principal
-
- getGuestGroupId() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getGuestGroupName() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getGuestId() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getGuestName() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getHeight() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Returns the height of the region.
- getHistogram(int[], int, boolean, PlaneDef) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getHost() - クラス のメソッドome.system.Server
-
simple getter for the server host passed into the constructor
- getHypercube(List<Integer>, List<Integer>, List<Integer>) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getImages(Class<T>, Set<Long>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Retrieve a user's (or all users') images within any given container.
- getImagesByOptions(Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Retrieve images by options.
- getImagesBySplitFilesets(Map<Class<? extends IObject>, List<Long>>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Given a list of IDs of certain entity types, calculates which filesets are split such that
a non-empty proper subset of their images are referenced, directly or indirectly, as being
included.
- getImagesForDataset(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAnalysis
-
- getInput(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves an entry from the given session's
input
environment.
- getInputKeys(String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves all keys in the session's
input environment.
- getInputs(String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves all inputs from the given session's
input
environment.
- getInstance(String) - クラス のstaticメソッドome.system.OmeroContext
-
create (if necessary) and return the single default OmeroContext named by
the beanFactoryName parameter.
- getJob() - インタフェース のメソッドome.api.JobHandle
-
- getKeySet() - クラス のメソッドome.system.PreferenceContext
-
- getLdapService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getLeaderOfGroupIds(Experimenter) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Finds the ids for all groups for which the given Experimenter
is
owner/leader.
- getLeaderOfGroupsList() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getLeaderOfGroupsList() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getLowerLimit() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Returns the constant level for bit-planes < planeSelected w.r.t the
higher-order bits.
- getLutReaders(ChannelBinding[]) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.lut.LutProvider
-
Returns the list of lookup table readers that can be used by a set
of channel bindings.
- getManagedServerContext() - クラス のstaticメソッドome.system.OmeroContext
-
create (if necessary) and return the single default managed OmeroContext.
- getMax() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- getMax() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getMean() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- getMean() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getMedian() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- getMedian() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getMemberCount(Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Returns a map from share id to the count of total members (including the
owner).
- getMemberOfGroupIds(Experimenter) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Finds the ids for all groups for which the given Experimenter
is
a member.
- getMemberOfGroupsList() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- getMemberOfGroupsList() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- getMemberShares(boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets all shares where current Experimenter
is a member.
- getMemberSharesFor(Experimenter, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets all shares where given Experimenter
is a member.
- getMetadataService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getMin() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- getMin() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getModel() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the model that dictates how transformed raw data has to be mapped
onto a color space.
- getMyOpenAgentSessions(String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
- getMyOpenClientSessions() - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
- getMyOpenSessions() - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Returns a list of open sessions for the current user.
- getMyUserPhotos() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
- getName() - クラス のメソッドome.system.Login
-
simple getter for the user name passed into the constructor
- getName() - クラス のメソッドome.system.Preference
-
- getName() - クラス のメソッドome.system.Principal
-
- getOriginalEnumerations() - インタフェース のメソッドome.api.ITypes
-
Gets all original values.
- getOutput(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves an entry from the session's
output environment.
- getOutputKeys(String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves all keys in the sesson's
output environment.
- getOutputs(String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves all outputs from the given session's
input
environment.
- getOwnShares(boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets all owned shares for the current Experimenter
- getPassword() - クラス のメソッドome.system.Login
-
simple getter for the password passed into the constructor
- getPastConnections(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets previous connections to share
.
- getPixels() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the Pixels
set the Rendering engine is for.
- getPixelsId() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
Returns the current Pixels set identifier.
- getPixelsPath() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
Returns the current Pixels path.
- getPixelsService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getPixelsTypeLowerBound(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the minimum value for that channels depending on the pixels
type and the original range (globalmax, globalmin)
- getPixelsTypeUpperBound(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the maximum value for that channels depending on the pixels
type and the original range (globalmax, globalmin)
- getPlane(int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getPlaneOffset(int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getPlanePrevious() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Returns the value corresponding to the index of the bit-plane ranged just
before the one selected.
- getPlaneRegion(int, int, int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getPlaneSelected() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Returns the value corresponding to the index of the selected bit-plane.
- getPlaneSize() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
Returns the plane size
- getPort() - クラス のメソッドome.system.Server
-
simple getter for the port passed into the constructor or the default
port if none.
- getPrefix() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getProjectionService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getProjectsForDataset(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAnalysis
-
- getProjectsForUser(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAnalysis
-
- getProperty(String) - クラス のメソッドome.system.OmeroContext
-
- getProperty(String) - クラス のメソッドome.system.PreferenceContext
-
Lookup method for getting access to the merged
properties
for this instance.
- getProvider(ChecksumType) - インタフェース のメソッドome.util.checksum.ChecksumProviderFactory
-
- getProvider(ChecksumType) - クラス のメソッドome.util.checksum.ChecksumProviderFactoryImpl
-
- getQuantumDef() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the quantization object.
- getQueryService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getRed(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.lut.LutReader
-
Returns the red value.
- getRedBand() - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Returns the data buffer for the red band.
- getRedValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Retrieves the Red value for a particular pixel index.
- getRedValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Retrieves the Red value for a particular pixel index.
- getRedValue(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Retrieves the Red value for a particular pixel index.
- getReferenceCount(String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves the current reference count for the given uuid.
- getRegion(int, long) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getRegion() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns the region to render.
- getRenderingDefId() - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Return the id of the RenderingDef
loaded in
this instance.
- getRenderingDefId() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- getRenderingSettings(long) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Returns the default rendering settings for a given pixels for the
current user.
- getRenderingSettingsService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getRenderShapes() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns whether or not the shapes (masks) will be rendered.
- getRepositoryInfoService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getResolutionDescriptions() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getResolutionDescriptions() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- getResolutionLevel() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getResolutionLevel() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- getResolutionLevels() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getResolutionLevels() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- getRGBA(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns a 4D-array representing the color associated to the specified
channel.
- getRootId() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getRootName() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getRow(int, int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getRowOffset(int, int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getRowSize() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getSecurityRoles() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
returns the active
Roles
in use by the server.
- getServerTime() - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
checks the current server for its time.
- getServiceByClass(Class<T>) - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
looks up services based on the current
prefix
and
the class name of the service type.
- getServiceInterface() - インタフェース のメソッドome.system.SelfConfigurableService
-
- getSession(String) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Retrieves the session associated with this uuid, updating the last access
time as well.
- getSession() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getSession() - クラス のメソッドome.system.SessionInitializer
-
- getSessionInitializer() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getSessionService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getSetting() - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
Gets config value from properties.
- getShapeIds() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns whether or not the shapes (masks) will be rendered.
- getShare(long) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets a share as a Session
with all related:
comments
,
members
, fully loaded.
- getShareService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getSharesOwnedBy(Experimenter, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Gets all shares owned by the given Experimenter
.
- getSizeX1() - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Returns the number of pixels on the X1-axis.
- getSizeX2() - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Returns the number of pixels on the X2-axis.
- getSlice() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns an identifier to tell which kind of plane this object identifies.
- getSnapshot() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultHistogram
-
- getSnapshot() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Histogram
-
- getStack(int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getStackOffset(int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getStackSize() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getStdDev() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- getStdDev() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getStride() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns the stride.
- getSystemGroupId() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getSystemGroupName() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getT() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns the timepoint.
- getTaggedObjectsCount(Set<Long>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Returns a map whose key is a tag's id and the value the number of
Projects, Datasets, and Images linked to that tag.
- getThumbnail(Integer, Integer) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a thumbnail for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef).
- getThumbnailByLongestSide(Integer) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a thumbnail for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef).
- getThumbnailByLongestSideDirect(Integer) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a thumbnail for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef).
- getThumbnailByLongestSideSet(Integer, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a number of thumbnails for pixels sets using given sets of
rendering settings (RenderingDef).
- getThumbnailDirect(Integer, Integer) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a thumbnail for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef).
- getThumbnailForSectionByLongestSideDirect(int, int, Integer) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a thumbnail for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef) for a particular section.
- getThumbnailForSectionDirect(int, int, Integer, Integer) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a thumbnail for a pixels set using a given set of rendering
settings (RenderingDef) for a particular section.
- getThumbnailSet(Integer, Integer, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Retrieves a number of thumbnails for pixels sets using given sets of
rendering settings (RenderingDef).
- getTile(int, int, int, int, int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getTileSize() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getTileSize() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- getTimepoint(int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getTimepointOffset(int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getTimepointSize() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getTotalSize() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- getTypesService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getUpdateService() - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- getUpgradeUrl() - クラス のメソッドome.system.UpgradeCheck
-
- getUpperLimit() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Returns the constant level for bit-planes > planeSelected w.r.t the
higher-order bits.
- getUsageFraction() - インタフェース のメソッドome.api.IRepositoryInfo
-
This method returns a double of the used space divided by the free space.
- getUsedSpaceInKilobytes() - インタフェース のメソッドome.api.IRepositoryInfo
-
This method returns the total space in bytes for this file system
including nested subdirectories.
- getUserGroupId() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getUserGroupName() - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- getUserImages(Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Retrieve a user's images.
- getValue(double) - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- getValue(double) - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getValues() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- getValues() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- getVersion() - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
Provides the release version.
- getVisibility() - クラス のメソッドome.system.Preference
-
- getWidth() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Returns the width of the region.
- getX() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns the index of the plane in the set identified by this object.
- getX() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Returns the x-coordinate of the top-left corner.
- getXEnd() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the x-coordinate of the pEnd
point.
- getXStart() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the x-coordinate of the pStart
point.
- getY() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns the index of the plane in the set identified by this object.
- getY() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Returns the y-coordinate of the top-left corner.
- getYEnd() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the y-coordinate of the pEnd
point.
- getYStart() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Returns the y-coordinate of the pStart
point.
- getZ() - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns the index of the plane in the set identified by this object.
- greens - クラス の変数omeis.providers.re.lut.LutReader
-
Holds the green values.
- group - クラス の変数ome.system.Principal
-
- GUEST - クラス のstatic変数ome.system.Login
-
Login
constant which has username and password values set
to null and other values set to their default.
- IAdmin - ome.apiのインタフェース
-
Administration interface providing access to admin-only functionality as well
as JMX-based server access and selected user functions.
- IAnalysis - ome.apiのインタフェース
-
Provides access to the model objects involved in analysis.
- IConfig - ome.apiのインタフェース
-
Access to server configuration.
- IContainer - ome.apiのインタフェース
-
Provides methods for dealing with the core "Pojos" of OME.
- IDelete - ome.apiのインタフェース
-
Provides simplifed methods for deleting instances from the database.
- IdentityMapContext - omeis.providers.re.codomainのクラス
-
An empty context for the identity map.
- IdentityMapContext() - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.codomain.IdentityMapContext
-
- ILdap - ome.apiのインタフェース
-
Administration interface providing access to admin-only functionality as well
as JMX-based server access and selected user functions.
- IMetadata - ome.apiのインタフェース
-
Provides method to interact with acquisition metadata and
annotations.
- inc() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Counter
-
- inc() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultCounter
-
- indexObject(IObject) - インタフェース のメソッドome.api.IUpdate
-
Initiates full-text indexing for the given object.
- InternalMessage - ome.util.messagesのクラス
-
- InternalMessage(Object) - クラス のコンストラクタome.util.messages.InternalMessage
-
Sole constructor which takes the "source" of this EventObject
.
- intervalEnd - クラス の変数omeis.providers.re.codomain.CodomainMapContext
-
The upper bound of the codomain interval.
- intervalStart - クラス の変数omeis.providers.re.codomain.CodomainMapContext
-
The lower bound of the codomain interval.
- invalidateConnection(long, Experimenter) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Makes the connection invalid for share
for
specifiec user.
- InvalidQueryException - ome.util.searchの例外
-
Exception to indicate that the query string was invalid
- InvalidQueryException() - 例外 のコンストラクタome.util.search.InvalidQueryException
-
- InvalidQueryException(String, Throwable) - 例外 のコンストラクタome.util.search.InvalidQueryException
-
- InvalidQueryException(String) - 例外 のコンストラクタome.util.search.InvalidQueryException
-
- InvalidQueryException(Throwable) - 例外 のコンストラクタome.util.search.InvalidQueryException
-
- IPixels - ome.apiのインタフェース
-
- IProjection - ome.apiのインタフェース
-
Provides methods for performing projections of Pixels sets.
- IQuery - ome.apiのインタフェース
-
Provides methods for directly querying object graphs.
- IRenderingSettings - ome.apiのインタフェース
-
Provides method to apply rendering settings to a collection of images.
- IRepositoryInfo - ome.apiのインタフェース
-
Provides methods for obtaining information for server repository disk space
allocation.
- IS_ROOT_USER - クラス の変数ome.system.Roles
-
- IS_SYSTEM_GROUP - クラス の変数ome.system.Roles
-
- IS_USER_GROUP - クラス の変数ome.system.Roles
-
- isActive(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns true
if the channel is mapped, false
otherwise.
- isAdmin - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- isAllowLeadingWildcard() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Returns the current leading-wildcard setting.
- IScale - ome.apiのインタフェース
-
Provides methods for performing scaling (change of the image size through
interpolation or other means) on BufferedImages.
- isCaseSensitive() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Returns the current case sensitivity setting.
- IsConstant() - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Returns the type of bit-planes mapping.
- isCurrentUserAdmin() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- isCurrentUserAdmin() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- isDb() - クラス のメソッドome.system.Preference
-
- ISession - ome.apiのインタフェース
-
Start here: Session
creation service for OMERO.
- isExceptionThrown() - クラス のメソッドome.system.UpgradeCheck
-
- isFloat() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- IShare - ome.apiのインタフェース
-
非推奨です。
- isInProgress() - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
This returns the last available in progress state for a
thumbnail.
- isMergedBatches() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Returns the current merged-batches setting.
- isPixelsTypeSigned() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns true
if the pixels type is signed,
false
otherwise.
- isPrefs() - クラス のメソッドome.system.Preference
-
- isReadOnly() - インタフェース のメソッドome.system.EventContext
-
- isReadOnly - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- isReadOnly() - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- isReturnUnloaded() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Returns the current return-unloaded setting.
- isRootUser(Experimenter) - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- isSigned() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- isSystemGroup(ExperimenterGroup) - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- isThreadSafe() - クラス のメソッドome.util.messages.InternalMessage
-
Returns true if this message can safely be passed to another
Thread
.
- isUpgradeNeeded() - クラス のメソッドome.system.UpgradeCheck
-
- isUseProjections() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Returns the current use-projection setting.
- isUserGroup(ExperimenterGroup) - クラス のメソッドome.system.Roles
-
- ITypes - ome.apiのインタフェース
-
Access to reflective type information.
- IUpdate - ome.apiのインタフェース
-
Provides methods for directly updating object graphs.
- leaderOfGroups - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- link(ILink[], Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Convenience method for creating links.
- load() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Creates a instance of the rendering engine.
- loadAnnotation(Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads the specified annotations.
- loadAnnotations(Class<T>, Set<Long>, Set<String>, Set<Long>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads all the annotations of given types,
that have been attached to the specified rootNodes
for the specified annotatorIds
.
- loadAnnotationsUsedNotOwned(Class, long) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads the annotations of a given type used by the specified
user but not owned by the user.
- loadChannelAcquisitionData(Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads the logical channels
and the acquisition metadata
related to them.
- loadContainerHierarchy(Class<T>, Set<Long>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Retrieves hierarchy trees rooted by a given node (unless orphan is
specified -- See below)
This method also retrieves the Experimenters linked to the objects in the
tree.
- loadInstrument(long) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads the instrument and its components i.e. detectors, objectives, etc.
- loadLogFiles(Class<? extends IObject>, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Find the original file IDs for the import logs corresponding to the given Image or Fileset IDs.
- loadRenderingDef(long) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Loads a specific set of rendering settings that does not necessarily
have to be linked to the given Pixels set.
- loadRndSettings(long) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Loads a specific set of rendering settings with the following objects
pre-linked:
renderingDef.quantization
renderingDef.model
renderingDef.waveRendering
renderingDef.waveRendering.color
renderingDef.waveRendering.family
renderingDef.spatialDomainEnhancement
- loadSpecifiedAnnotations(Class, Set<String>, Set<String>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads all the annotations of a given type.
- loadSpecifiedAnnotationsLinkedTo(Class, Set<String>, Set<String>, Class, Set<Long>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads the annotations of a given type linked to the specified objects.
- loadTagContent(Set<Long>, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads the Tag Set if the id is specified otherwise loads all the Tag
Set.
- loadTagSets(Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IMetadata
-
Loads all the tag Sets.
- Locator() - クラス のコンストラクタome.system.OmeroContext.Locator
-
- Login - ome.systemのクラス
-
Provides simplified handling of login properties when creating a
ServiceFactory
.
- Login(String, String) - クラス のコンストラクタome.system.Login
-
standard constructor which leaves OMERO_GROUP and OMERO_EVENT null.
- Login(String, String, String, String) - クラス のコンストラクタome.system.Login
-
extended constructor.
- lookup(String, ApplicationContext) - クラス のメソッドome.system.OmeroContext.Locator
-
uses
ContextSingletonBeanFactoryLocator.createDefinition(java.lang.String, java.lang.String)
and
ContextSingletonBeanFactoryLocator.initializeDefinition(org.springframework.beans.factory.BeanFactory)
to create a new context from a given definition.
- lookupExperimenter(String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
look up an Experimenter
and all related
groups
by name.
- lookupExperimenters() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Looks up all experimenters
present and all related
groups
.
- lookupGroup(String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
look up an ExperimenterGroup
and all contained
users
by name.
- lookupGroups() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Looks up all groups
present and all related
experimenters
.
- lookupLdapAuthExperimenter(long) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Looks up experimenters
who uses LDAP authentication
(has set dn on password table).
- lookupLdapAuthExperimenters() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Looks up all id of experimenters
who uses LDAP
authentication (has set dn on password table).
- lookupPixels(long) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Loads the Pixels
set this Rendering Engine is for.
- lookupRenderingDef(long) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Loads the rendering settings associated to the specified pixels set.
- LuceneQueryBuilder - ome.util.searchのクラス
-
Utility class for building lucene queries
Example:
Fields to search for: 'name', 'description'
Input query: a b AND c AND d f
will be transformed to this lucene expression:
name:a description:a name:f description:f ((name:b description:b) AND (name:c
description:c) AND (name:d description:d))
- LuceneQueryBuilder() - クラス のコンストラクタome.util.search.LuceneQueryBuilder
-
- LutProvider - omeis.providers.re.lutのインタフェース
-
Interface for lookup table providers.
- LutReader - omeis.providers.re.lutのクラス
-
Class to be extended by LUT reader.
- LutReaderFactory - omeis.providers.re.lutのクラス
-
Initializes the reader corresponding to the specified lookup table.
- LutReaderFactory() - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.lut.LutReaderFactory
-
- R_BAND - クラス のstatic変数omeis.providers.re.RGBBuffer
-
Index of the red band in the image's data buffer.
- raw - クラス の変数omeis.providers.re.lut.LutReader
-
Flag indicating to read 32 byte NIH Image LUT header.
- RawFileStore - ome.apiのインタフェース
-
Raw file gateway which provides access to the OMERO file repository.
- RawPixelsStore - ome.apiのインタフェース
-
Binary data provider.
- read(long, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawFileStore
-
Reads length
bytes of data at the position
from the raw
file into an array of bytes
- read(String, String) - クラス のstaticメソッドomeis.providers.re.lut.LutReaderFactory
-
Reads the specified file.
- read(File) - クラス のstaticメソッドomeis.providers.re.lut.LutReaderFactory
-
Reads the specified file.
- reds - クラス の変数omeis.providers.re.lut.LutReader
-
Holds the red values.
- refresh(T) - インタフェース のメソッドome.api.IQuery
-
refreshes an entire IObject
graph, recursive loading all data for
the managed instances in the graph from the database.
- refreshAll() - クラス のメソッドome.system.OmeroContext
-
refreshes all the nested OmeroContexts within this instance.
- refreshAllIfNecessary() - クラス のメソッドome.system.OmeroContext
-
- RegionDef - omeis.providers.re.dataのクラス
-
Identifies a rectangular region.
- RegionDef() - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Creates a default instance.
- RegionDef(int, int, int, int) - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Creates a rectangular region.
- remove() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Unsupported operation.
- removeCodomainMap(CodomainMapContext) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
非推奨です。
- removeCodomainMapFromChannel(CodomainMapContext, int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Removes the specified context from the chain.
- removeGroupOwners(ExperimenterGroup, Experimenter...) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
removes the given users from the owner list for this group.
- removeGroups(Experimenter, ExperimenterGroup...) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Removes an experimenter from the given groups.
- removeGuest(long, String) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Removes guest email address from share.
- removeGuests(long, String...) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Removes guest email addresses from the share.
- removeObject(long, T) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Removes existing object
from the
share
.
- removeObjects(long, T...) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Remove existing items from the share.
- removeUnusedFiles() - インタフェース のメソッドome.api.IRepositoryInfo
-
Removes all files from the server that do not have an OriginalFile
complement in the database, all the Pixels that do not have a complement
in the database and all the Thumbnail's that do not have a complement in
the database.
- removeUser(long, Experimenter) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Removes experimenter
from
share
- removeUsers(long, List<Experimenter>) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
Removes experimenters
from
share
- render(PlaneDef) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Renders the data selected by pd
according to the current
rendering settings.
- renderAsPackedInt(PlaneDef) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Renders the data selected by pd
according to the current
rendering settings.
- renderCompressed(PlaneDef) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Renders the data selected by pd
according to the current
rendering settings and compresses the resulting RGBA composite image.
- RenderingEngine - omeis.providers.reのインタフェース
-
Defines a service to render a given pixels set.
- renderProjectedAsPackedInt(int, int, int, int, int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Performs a projection through selected optical sections of a particular
timepoint with the currently active channels and renders the data for
display.
- renderProjectedCompressed(int, int, int, int, int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Performs a projection through selected optical sections of a particular
timepoint with the currently active channels, renders the data for
display and compresses the resulting RGBA composite image.
- reportForgottenPassword(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
非推奨です。
- REQUEUED - インタフェース のstatic変数ome.api.JobHandle
-
- requiresPixelsPyramid() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- requiresPixelsPyramid() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- resetDefaults(RenderingDef, Pixels) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets the given rendering settings to those that are specified by the
rendering engine intelligent pretty good image (PG) logic for
the pixels set linked to that set of rendering settings.
- resetDefaults() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Resets all settings (non-query state) to the original default values, as
if the instance had just be created.
- resetDefaults() - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
Resets the rendering definition for the active pixels set to its
default settings.
- resetDefaultsByOwnerInSet(Class<T>, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets the rendering settings of a given group of containers based on
the owner's (essentially a copy).
- resetDefaultSettings(boolean) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Resets the default settings i.e. the default values internal to the
Rendering engine.
- resetDefaultsForPixels(long) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets a Pixels' default rendering settings back to those that are
specified by the rendering engine intelligent pretty good image
(PG) logic.
- resetDefaultsInDataset(long) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets a dataset's rendering settings back to those that are specified
by the rendering engine intelligent pretty good image (PG) logic.
- resetDefaultsInImage(long) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets an image's default rendering settings back to those that are
specified by the rendering engine intelligent pretty good image
(PG) logic.
- resetDefaultsInSet(Class<T>, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets a rendering settings back to one or many containers that are
specified by the rendering engine intelligent pretty good image
(PG) logic.
- resetDefaultsNoSave(RenderingDef, Pixels) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets the given rendering settings to those that are specified by the
rendering engine intelligent pretty good image (PG) logic for
the pixels set linked to that set of rendering settings.
- resetEnumerations(Class<T>) - インタフェース のメソッドome.api.ITypes
-
- resetMinMaxInSet(Class<T>, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets a the channel windows for one or many containers back to their
global minimum and global maximum for the channel.
- resolveAlias(String) - クラス のメソッドome.system.PreferenceContext
-
- RESUBMITTED - インタフェース のstatic変数ome.api.JobHandle
-
- results() - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Returns up to
batch size
number of results along
with the related query metadata.
- retrieveAllRndSettings(long, long) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Retrieves all the rendering settings for a given pixels set and the
passed user with the following objects pre-linked:
renderingDef.quantization
renderingDef.model
renderingDef.waveRendering
renderingDef.waveRendering.color
renderingDef.waveRendering.family
renderingDef.spatialDomainEnhancement
- retrieveCollection(IObject, String, Parameters) - インタフェース のメソッドome.api.IContainer
-
Retrieves a collection with all members initialized ("loaded").
- retrievePixDescription(long) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Retrieves the pixels metadata with the following objects pre-linked:
pixels.pixelsType
pixels.pixelsDimensions
pixels.channels
pixels.channnels.statsInfo
pixels.channnels.colorComponent
pixels.channnels.logicalChannel
pixels.channnels.logicalChannel.photometricInterpretation
- retrieveRndSettings(long) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Retrieves the rendering settings for a given pixels set and the currently
logged in user.
- retrieveRndSettingsFor(long, long) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Retrieves the rendering settings for a given pixels set and the passed
user with the following objects pre-linked:
renderingDef.quantization
renderingDef.model
renderingDef.waveRendering
renderingDef.waveRendering.color
renderingDef.waveRendering.family
renderingDef.spatialDomainEnhancement
- ReverseIntensityContext - omeis.providers.re.codomainのクラス
-
- ReverseIntensityContext() - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.codomain.ReverseIntensityContext
-
非推奨です。
- RGBAIntBuffer - omeis.providers.reのクラス
-
Holds the data of an RGBA image.
- RGBAIntBuffer(int, int) - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Creates a new 4-band packed integer buffer.
- RGBBuffer - omeis.providers.reのクラス
-
Holds the data of an RGB image.
- RGBBuffer() - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Simple constructor to avoid memory allocations.
- RGBBuffer(int, int) - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Creates a new 3-band buffer.
- RGBIntBuffer - omeis.providers.reのクラス
-
Holds the data of an RGB image.
- RGBIntBuffer(int, int) - クラス のコンストラクタomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Creates a new 3-band packed integer buffer.
- Roles - ome.systemのクラス
-
encapsulates the naming scheme for critical system groups and accounts.
- Roles() - クラス のコンストラクタome.system.Roles
-
default constructor which assigns hard-coded values to all roles
- Roles(long, String, long, String, long, String, long, String, long, String) - クラス のコンストラクタome.system.Roles
-
constructor which allows full specification of all roles
- RolesAllowed - ome.annotationsの注釈型
-
Security annotation which specifies a list of user roles which will
be permitted to execute this method.
- run() - クラス のメソッドome.system.UpgradeCheck
-
If the
UpgradeCheck.url
has been set to null or the empty string, then no
upgrade check will be performed (silently).
- RUNNING - インタフェース のstatic変数ome.api.JobHandle
-
- sanityCheckPixels(Pixels, Pixels) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Checks if the specified sets of pixels are compatible.
- sanityCheckRepository() - インタフェース のメソッドome.api.IRepositoryInfo
-
Checks that image data repository has not exceeded 95% disk space use
level.
- save() - インタフェース のメソッドome.api.RawFileStore
-
Saves the OriginalFile
associated with the service if it has
been modified.
- save() - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- saveAndReturnArray(IObject[]) - インタフェース のメソッドome.api.IUpdate
-
- saveAndReturnIds(IObject[]) - インタフェース のメソッドome.api.IUpdate
-
Logic differs from other methods.
- saveAndReturnObject(T) - インタフェース のメソッドome.api.IUpdate
-
- saveArray(IObject[]) - インタフェース のメソッドome.api.IUpdate
-
- saveAsNewSettings() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Saves the current rendering settings in the database
as a new
RenderingDef
and loads the object
into the current
RenderingEngine
.
- saveCollection(Collection<IObject>) - インタフェース のメソッドome.api.IUpdate
-
- saveCurrentSettings() - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Saves the current rendering settings in the database.
- saveObject(IObject) - インタフェース のメソッドome.api.IUpdate
-
- saveRndSettings(RenderingDef) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Saves the specified rendering settings.
- scaleBufferedImage(BufferedImage, float, float) - インタフェース のメソッドome.api.IScale
-
Scales a buffered image using defined X and Y axis scale factors.
- SCORE - インタフェース のstatic変数ome.api.Search
-
String
constant used to look up the score value of Lucene queries
returned by this interface.
- Search - ome.apiのインタフェース
-
Central search interface, allowing Web2.0 style queries.
- searchAll() - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
Searches all Experimenter
list on LDAP for
attribute objectClass = person.
- searchByAttribute(String, String, String) - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
Searches all Experimenter
in LDAP for specified
attribute
- searchByAttributes(String, String[], String[]) - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
Searches all Experimenter
in LDAP for specified
attributes.
- searchByDN(String) - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
Searches one Experimenter
in LDAP for specified
Distinguished Name - String
- searchDnInGroups(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
Searches Distinguished Name - String
in groups
- SelfConfigurableService - ome.systemのインタフェース
-
- selfConfigure() - インタフェース のメソッドome.system.SelfConfigurableService
-
- Server - ome.systemのクラス
-
Provides simplified handling of server properties when creating a
ServiceFactory
.
- Server(String) - クラス のコンストラクタome.system.Server
-
- Server(String, int) - クラス のコンストラクタome.system.Server
-
extended constructor.
- ServiceFactory - ome.systemのクラス
-
Entry point for all client calls.
- ServiceFactory() - クラス のコンストラクタome.system.ServiceFactory
-
- ServiceFactory(Login) - クラス のコンストラクタome.system.ServiceFactory
-
constructor which obtains a new (non-static)
client context
, passing
in the
Properties
representation of the
Login
for
configuration.
- ServiceFactory(Server) - クラス のコンストラクタome.system.ServiceFactory
-
constructor which obtains a new (non-static)
client context
, passing
in the
Properties
representation of the
Server
for
configuration.
- ServiceFactory(Server, Login) - クラス のコンストラクタome.system.ServiceFactory
-
constructor which obtains a new (non-static)
client context
, passing
in the
Properties
representation of both the
Server
and
the
Login
for configuration.
- ServiceFactory(Properties) - クラス のコンストラクタome.system.ServiceFactory
-
constructor which obtains a new
client context
, passing
in the provided properties for configuration.
- ServiceFactory(OmeroContext) - クラス のコンストラクタome.system.ServiceFactory
-
constructor which uses the provided
OmeroContext
for all
loookups.
- ServiceFactory(String) - クラス のコンストラクタome.system.ServiceFactory
-
constructor which finds the global static
OmeroContext
with the
given name.
- ServiceInterface - ome.apiのインタフェース
-
Marker interface representing an OMERO API Interface.
- session - クラス の変数ome.system.SessionInitializer
-
- SessionInitializer - ome.systemのクラス
-
Manages the creation of a single
Session
created via the injected
ISession
service.
- SessionInitializer() - クラス のコンストラクタome.system.SessionInitializer
-
- sessions - クラス の変数ome.system.SessionInitializer
-
- setActive(long, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
- setActive(int, boolean) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Maps the specified channel if true
, unmaps the channel
otherwise.
- setAdminPrivileges(Experimenter, List<AdminPrivilege>) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
Sets the set of light administrator privileges for the given user.
- setAliases(String[]) - クラス のメソッドome.system.Preference
-
Setter injector
- setAllowLeadingWildcard(boolean) - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Permits full-text queries with a leading query if true.
- setBatchSize(int) - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Sets the maximum number of results that will be returned by one call to
Search.results()
.
- setBeanName(String) - クラス のメソッドome.system.Preference
-
Setter injector
- setBeginsWith(Collection<String>) - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultMetrics
-
- setBlueValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Sets the Blue value for a particular pixel index.
- setBlueValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Sets the Blue value for a particular pixel index.
- setBlueValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Sets the Blue value for a particular pixel index.
- setCaseSentivice(boolean) - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Sets the case sensitivity on all queries where case-sensitivity is
supported.
- setChannelGlobalMinMax(long, int, double, double) - インタフェース のメソッドome.api.IPixels
-
Sets the channel global (all 2D optical sections corresponding to a
particular channel) minimum and maximum for a Pixels set.
- setChannelLookupTable(int, String) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- setChannelWindow(int, double, double) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Returns the pixels intensity interval.
- setCodomain(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.CodomainMapContext
-
Sets the codomain interval.
- setCodomainInterval(int, int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Sets the sub-interval of the device space i.e. a discrete sub-interval of
[0, 255]
- setCompressionLevel(float) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Sets the current compression level for the service.
- setConfigValue(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
set a configuration value in the backend store.
- setConfigValueIfEquals(String, String, String) - インタフェース のメソッドome.api.IConfig
-
- setConstant(boolean) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Sets the type of mapping.
- setContext(CodomainMapContext) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.codomain.CodomainMap
-
Sets the parameters used to write the equation of the specified codomain
transformation.
- setCoordinates(int, int, int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Sets the coordinates of the points used to determine the equations of the
lines.
- setCredentials(String) - クラス のメソッドome.system.SessionInitializer
-
- setDb(boolean) - クラス のメソッドome.system.Preference
-
Setter injector
- setDefaultGroup(Experimenter, ExperimenterGroup) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
sets the default group for a given user.
- setDefaultT(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Sets the default timepoint index.
- setDefaultZ(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Sets the index of the default focal section.
- setDescription(long, String) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
- setDN(Long, String) - インタフェース のメソッドome.api.ILdap
-
- setExpiration(long, Timestamp) - インタフェース のメソッドome.api.IShare
-
非推奨です。
- setFileId(long) - インタフェース のメソッドome.api.RawFileStore
-
This method manages the state of the service.
- setGraphiteAddress(String) - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultMetrics
-
- setGreenValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Sets the Green value for a particular pixel index.
- setGreenValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Sets the Green value for a particular pixel index.
- setGreenValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Sets the Green value for a particular pixel index.
- setGroupOwner(ExperimenterGroup, Experimenter) - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
adds the user to the owner list for this group.
- setGroupPermissions(Permissions) - クラス のメソッドome.system.SimpleEventContext
-
- setHeight(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Sets the height of the region.
- setInput(String, String, Object) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Places an entry in the given session's
input environment.
- setLimits(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Set the limits.
- setLowerLimit(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Sets the value (in [intervalStart, intervalEnd]) used to set the level of
the bit-plane < bit-plane selected.
- setMergedBatches(boolean) - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Set whether or not results from two separate queries can be returned in
the same call to
Search.results()
.
- setMessage(String) - インタフェース のメソッドome.api.JobHandle
-
Sets the job's message string, and returns the previous value.
- setModel(RenderingModel) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Specifies the model that dictates how transformed raw data has to be
mapped onto a color space.
- setMutable(boolean) - クラス のメソッドome.system.Preference
-
Setter injector
- setOriginalSettingsForPixels(long) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets an Pixels' default rendering settings back to channel global
minimum and maximum.
- setOriginalSettingsInDataset(long) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets a dataset's rendering settings back to channel global
minimum and maximum.
- setOriginalSettingsInImage(long) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets an image's default rendering settings back to channel global
minimum and maximum.
- setOriginalSettingsInSet(Class<T>, Set<Long>) - インタフェース のメソッドome.api.IRenderingSettings
-
Resets a rendering settings back to channel global minimum and maximum
for the specified containers.
- setOutput(String, String, Object) - インタフェース のメソッドome.api.ISession
-
Places an entry in the given session's
output
environment.
- setOverlays(Map<byte[], Integer>) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Informs the rendering engine that it should render a set of overlays on
each rendered frame.
- setPixelsId(long, boolean) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
Initializes the stateful service for a given Pixels set.
- setPixelsId(long) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
This method manages the state of the service; it must be invoked before
using any other methods.
- setPlane(byte[], int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- setPlanes(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Sets the value of the selected planes i.e. the previous plane and the
selected one.
- setPreferences(List<Preference>) - クラス のメソッドome.system.PreferenceContext
-
- setPrefs(boolean) - クラス のメソッドome.system.Preference
-
- setPrincipal(Principal) - クラス のメソッドome.system.SessionInitializer
-
- setProperty(String, String) - クラス のメソッドome.system.PreferenceContext
-
With ticket:2214, preferences are no longer mutable.
- setQuantizationMap(int, Family, double, boolean) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Sets the quantization map, one per channel.
- setQuantumStrategy(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Sets the quantization strategy.
- setRedValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBAIntBuffer
-
Sets the Red value for a particular pixel index.
- setRedValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBBuffer
-
Sets the Red value for a particular pixel index.
- setRedValue(int, int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.RGBIntBuffer
-
Sets the Red value for a particular pixel index.
- setRegion(int, long, byte[]) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- setRegion(RegionDef) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Sets the region to render.
- setRenderingDefId(long) - インタフェース のメソッドome.api.ThumbnailStore
-
- setRenderShapes(boolean) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Sets whether or not to render the shapes (masks).
- setResolutionLevel(int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- setResolutionLevel(int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
- setReturnUnloaded(boolean) - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Determines if all results should be returned as unloaded objects.
- setRGBA(int, int, int, int, int) - インタフェース のメソッドomeis.providers.re.RenderingEngine
-
Sets the four components composing the color associated to the specified
channel.
- setRow(byte[], int, int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- setSession(Session) - クラス のメソッドome.system.ServiceFactory
-
- setSession(Session) - クラス のメソッドome.system.SessionInitializer
-
- setSessionService(ISession) - クラス のメソッドome.system.SessionInitializer
-
- setShapeIds(List<Long>) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Sets whether or not to render the shapes (masks).
- setSlf4jMinutes(int) - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultMetrics
-
- setStack(byte[], int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- setStatus(String) - インタフェース のメソッドome.api.JobHandle
-
Updates the JobStatus
for the current job.
- setStatusAndMessage(String, String) - インタフェース のメソッドome.api.JobHandle
-
- setStride(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Returns the stride.
- setTile(byte[], int, int, int, int, int, int, int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- setTimepoint(byte[], int) - インタフェース のメソッドome.api.RawPixelsStore
-
- setUpperLimit(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.PlaneSlicingContext
-
Sets the value (in [intervalStart, intervalEnd]) used to set the level of
the bit-plane > bit-plane selected.
- setUseProjections(boolean) - インタフェース のメソッドome.api.Search
-
Determines if Lucene queries should not hit the database.
- setVisibility(Preference.Visibility) - クラス のメソッドome.system.Preference
-
Setter injector
- setWidth(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Sets the width of the region.
- setX(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Selects a plane in the set identified by this object.
- setX(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Sets the x-coordinate of the top-left corner.
- setXEnd(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Sets the x-coodinate of the pEnd
point.
- setXStart(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Sets the x-coodinate of the pStart
point.
- setY(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Selects a plane in the set identified by this object.
- setY(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.RegionDef
-
Sets the y-coordinate of the top-left corner.
- setYEnd(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Sets the y-coodinate of the pEnd
point.
- setYStart(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.codomain.ContrastStretchingContext
-
Sets the y-coodinate of the pStart
point.
- setZ(int) - クラス のメソッドomeis.providers.re.data.PlaneDef
-
Selects a plane in the set identified by this object.
- SHA1ChecksumProviderImpl - ome.util.checksumのクラス
-
An implementation of the
ChecksumProvider
interface using SHA1
as the secure hash algorithm.
- SHA1ChecksumProviderImpl() - クラス のコンストラクタome.util.checksum.SHA1ChecksumProviderImpl
-
- shareId - クラス の変数ome.system.SimpleEventContext
-
- ShutdownMessage - ome.util.messagesのクラス
-
Published when the server is shutting down.
- ShutdownMessage(Object) - クラス のコンストラクタome.util.messages.ShutdownMessage
-
- SiftingWhileRejectingDefaultAppender - ome.util.logbackのクラス
-
- SiftingWhileRejectingDefaultAppender() - クラス のコンストラクタome.util.logback.SiftingWhileRejectingDefaultAppender
-
- signal - クラス の変数ome.util.messages.UserSignalMessage
-
- SimpleEventContext - ome.systemのクラス
-
- SimpleEventContext() - クラス のコンストラクタome.system.SimpleEventContext
-
Constructor for subclasses
- SimpleEventContext(EventContext) - クラス のコンストラクタome.system.SimpleEventContext
-
copy constructor.
- size() - インタフェース のメソッドome.api.RawFileStore
-
Returns the size of the file on disk (not as stored in the database since
that value will only be updated on
RawFileStore.save()
.
- size() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultSnapshot
-
- size() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Snapshot
-
- Snapshot - ome.system.metricsのインタフェース
-
Thin wrapper around Snapshot
- StatefulServiceInterface - ome.apiのインタフェース
-
OMERO API Interface with stateful semantics.
- stop() - クラス のメソッドome.system.metrics.DefaultTimer.Context
-
- stop() - インタフェース のメソッドome.system.metrics.Timer.Context
-
- submit(Job) - インタフェース のメソッドome.api.JobHandle
-
Submits a Job
and returns its database id.
- SUBMITTED - インタフェース のstatic変数ome.api.JobHandle
-
- SUM_INTENSITY - インタフェース のstatic変数ome.api.IProjection
-
Sum intensity projection
- synchronizeLoginCache() - インタフェース のメソッドome.api.IAdmin
-
uses JMX to refresh the login cache if supported.